細菌16S rDNA菌種鑒定
通過DNA測序?qū)ξ⑸镞M行物種鑒定(菌種鑒定)是比傳統(tǒng)生化鑒定更先進的鑒定方法。DNA測序不依賴菌種本身特點,對所有菌種均可使用。比傳統(tǒng)生化鑒定更加快速,準確。信諾金達公司提供的微生物物種鑒定服務(wù)包括細菌16srDNA鑒定和真菌ITS鑒定,通過PCR擴增16SrDNA,測序后在GeneBank或者Eztaxon對比即可。一般序列相似度在97%以上就可以認為是同種菌種。信諾金達通過大量實驗優(yōu)化的通用引物適用于99%以上的微生物,鑒定成功率在98%以上。
服務(wù)要求
1.樣品形式可以是新鮮菌液、斜面培養(yǎng)基、平面培養(yǎng)基或者提取好的DNA。
2.如果樣品為基因組DNA,DNA濃度>10ng/ul,體積大于20ul。
3.鑒定結(jié)果一般可以鑒定到種。個別菌種由于微生物數(shù)據(jù)庫相關(guān)數(shù)據(jù)缺乏,只能鑒定到屬。如遇這種情況,正常收費。
4.如果測序結(jié)果出現(xiàn)如下套峰,視為樣品不純,本公司將收取全額實驗費用。并建議克隆多個測序鑒定。
5.對于某些致病性菌體,請?zhí)崆罢f明,注意保護工作人員健康及環(huán)境衛(wèi)生。
服務(wù)基本流程
1.信諾金達進行引物設(shè)計合成;
2.PCR擴增16S rDNA;
3.PCR產(chǎn)物純化;
4.測序,序列比對分析。
服務(wù)報告內(nèi)容
實驗報告包括PCR產(chǎn)物照片、NCBI序列比對鑒定結(jié)果、測序報告、序列堿基圖;
注:對于鑒定的菌株,我們不做備份及保留,請送檢之前做好保種工作。
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